Cancer Discovery：全面的临床测序为儿童癌症的精准治疗打开大门

发布时间：2021-07-28 信息来源：生物360

圣裘德儿童研究医院的研究人员近日证明，对所有儿童癌症患者进行全面的基因组测序是可行的，有望利用精准医疗来拯救儿童患者的生命。该研究成果发表在《Cancer Discovery》杂志在线版上。

研究人员向 309 名参与研究的患者提供了生殖系 DNA 的全基因组和全外显子测序，并对 253 名可获得足够肿瘤样本的患者开展了肿瘤 DNA 的全基因组、全外显子组和 RNA 测序。

总的来说，86% 的患者在肿瘤 DNA 或生殖系 DNA 中至少带有一个临床相关的变异，包括与诊断、预后、治疗或癌症易感性相关的变异。研究人员估计，五分之一的患者带有标准测序方法无法检测到的临床相关突变。

文章的通讯作者、圣裘德儿童研究医院计算生物学系的 Jinghui Zhang 博士表示：“一些最具临床相关性的发现之所以成为可能，是因为该研究将全基因组测序与全外显子组和 RNA 测序结合在一起。”

每年，全球预计约有 30 万名儿童和青少年患上癌症。全面的临床测序（包括全基因组、全外显子组和 RNA 测序）到目前为止尚未广泛使用。不过，随着这项技术越来越便宜，越来越多的患者有望使用到。研究人员表示，全面的临床测序将成为儿童癌症护理的重要补充。

“我们想要改变这个领域的思维方式，”David Wheeler 博士说，他是圣裘德精准基因组学团队的负责人。“我们展示了在患者层面使用基因组数据的潜力。即使是普通的儿科癌症，每个肿瘤都是独一无二的，每位患者也是独一无二的。”

在 78 例标准治疗不成功的患者中，肿瘤测序指导了 12 例患者的治疗方法改变。在这 12 例患者中，有 4 例患者因此稳定了病情并延长了生命。另一位患有急性髓系白血病的患者进入缓解期，并通过造血干细胞移植而治愈。

“通过这项研究中的全面基因组检测，我们能够清楚地识别可采用靶向药物治疗的肿瘤变异，为肿瘤学家如何管理他们的患者打开了大门，” 共同通讯作者、圣裘德癌症易感性部门的主任 Kim Nichols 博士说。

圣裘德儿童研究医院在了解、治疗和治愈儿童期癌症与其他致命疾病方面位居世界前列。它的 Genomes for Kids（G4K）项目帮助启动了医院的临床基因组计划，迄今已招募了约 2,700 名癌症患者。

与此同时，通过 Genomes for Kids 研究生成的数据可免费提供给全球研究界使用。通过共享数据，圣裘德旨在加快对儿童癌症的了解和治疗。这些数据可从圣裘德的云端获得。

“即使是最容易治疗的癌症，也并非所有患者都能治愈。例如，对于最常见的儿童癌症——急性淋巴细胞白血病，复发仍是主要的死亡原因。若要了解和预测哪些患者会对治疗有反应，哪些患者不会，就需要收集所有患者的全面基因组数据，”Nichols 谈道。